As disciplinas optativas conferem três créditos cada uma e têm por objetivo oferecer uma profunda base conceitual que permita o aluno construir a estrutura teórica que fundamentará a sua pesquisa, coerente com a linha de pesquisa em que o discente pretende desenvolver o seu projeto e defender a sua tese. O aluno deve cursar seis disciplinas (18 créditos). Cada linha de pesquisa oferece, a cada semestre, disciplinas optativas que não necessariamente são repetidas no semestre seguinte. As disciplinas optativas são oferecidas indistintamente aos alunos de Mestrado e Doutorado. O aluno tem a liberdade de escolher disciplinas fora de sua linha de pesquisa, desde que o conjunto de disciplinas tenha coerência com seu foco de estudo. A decisão do grupo de disciplinas ocorrerá com a ajuda do orientador e do coordenador do Programa. Existe também a possibilidade de o aluno cursar disciplinas em outras instituições com as quais a Universidade Presbiteriana Mackenzie tem acordo de colaboração.
